VASP
VASP全称原子尺度材料模拟的计算机程序包,是用于执行从头计算量子力学的分子动力学(MD)使用Vanderbilt泛函,或投增强波的方法和一个平面波基组的程序包。
用新建任务模式如何提交任务
一、 提交流程
登录 Fastone 平台控制台;
数据管理上传计算文件;
在首页,点击【提交作业】-点击【VASP】应用-选择任务模式-选择机器配置,进行启用机器;
上传计算文件,设置资源参数;
二、单机模式
Step 1:首页选择【提交作业】,如图:
Step 2:选择应用【VASP】
Step 3. 上传输入文件,配置运行参数;
可以设置提交的作业名。
可点击感叹号查看待上传输入文件的格式、软件运行参数的注意事项等。
以单个氧原子为例:
将 VASP 的所有输入文件放到同一个文件夹中,其中INCAR文件为入口文件;
通过数据管理上传整个文件夹;
新建任务,手动选择INCAR文件作为输入文件。
Step 4. 选择硬件配置;
根据软件版本和使用需求,选择CPU/GPU配置。
节点数量:设置启动多少个并行计算的计算节点。
内存配比:设置各个计算节点内存大小为单节点核心数×内存配比
Step 5. 查看作业内容汇总,并提交作业;
提交后的监控
提交任务,任务运行过程中可查看stdout.txt了解进度。
作业提交后可通过任务管理查看任务的输出和日志等内容。
可通过集群监控查看正在运行的计算节点资源使用率等信息。