Gaussian

量子化学领域最著名和应用最广泛的软件之一,由量子化学家约翰·波普的实验室开发,可以应用从头算方法、半经验计算方法等进行分子能量和结构;过渡态能量和结构;化学键及反应能量;分子轨道;偶极矩;多极矩;红外光谱和拉曼光谱,核磁共振,极化率和超极化率,热力学性质,反应路径等分子相关计算。

用图形桌面模式如何提交任务

一、 提交流程

登录 Fastone 平台控制台;

数据管理上传计算文件;

在首页,点击【提交作业】-点击【Gaussian】应用-选择图形桌面模式-选择机器配置,进行启用机器;

上传计算文件,设置资源参数;

二、单机模式

Step 1:首页选择【提交作业】,如图:

Step 2:选择【Gaussian】进行启用,如图:

  • 可以选择社区应用,选择【Gaussian-16-Linux】
  • 因软件适配性,建议启用intel型号机器,AMD型号机器可能会导致软件无法运行
  • 社区应用为用户自发分享的应用,有可能会启用失败

Step 3:在图形界面,选择创建的图形桌面,点击【VNC】

Step 4:进入图形桌面,打开Terminal,如图:

Step 5:运行脚本文件/tmp/gaussian16/config.sh,等待几分钟,脚本会完成环境配置

Step 6:执行测试脚本

执行测命令:以test0000.com输入文件为例。

~/public/software/gaussian16/run_gaussian16.sh test0000.com
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Step 7:结果文件查看

  • 在~/public/software/gaussian16/ 查看输出 test0000.log

  • 可以在GaussView中查看结果,执行下面命令,运行软件

~/public/software/gaussian16/run_gv.sh
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然后打开对应的.log文件即可查看结果